Czasami leczenie nie przynosi spodziewanej skuteczności. W takim przypadku, pierwszą czynnością jest zweryfikowanie naszej diagnozy (sekcja zwłok, włącznie z antybiogramem).
Jeżeli leczenie zakażenia bakteryjnego nie odpowiada na leczenia, mimo dobrania odpowiedniego antybiotyku na podstawie wyników z laboratorium, należy sprawdzić, czy zwierzęta otrzymują prawidłową dawkę leku. Otrzymanie zbyt niskiej dawki może mieć wiele przyczyn: